تکرار آنکرین
تکرار آنکرین (انگلیسی: Ankyrin repeat) یک موتیف ساختاری ۳۳تایی در پروتئینهاست که از ۲ مارپیچ آلفا تشکیل شدهاست که توسط یک حلقه از هم جدا میشوند. این موتیف نخستین بار در پروتئینهای نشانهگذاری یاخته در مخمر «Cdc10» و همچنین مگس سرکه کشف شد.
دومین تکرارشوندهٔ آنکرین | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
شناسهها | |||||||||||
نماد | Ank | ||||||||||
پیفم | PF00023 | ||||||||||
اینترپرو | IPR002110 | ||||||||||
SMART | SM00248 | ||||||||||
PROSITE | PDOC50088 | ||||||||||
SCOPe | 1awc / SUPFAM | ||||||||||
|
دومینهایی که حاوی «تکرارهای آنکرین» باشند، در تعامل پروتئین-پروتئین شرکت دارند و یکی از رایجترین موتیفهای ساختاری پروتئینها محسوب میشوند.
تکرار آنکرین در باکتریها، باستانیان و یوکاریوتها وجود دارند؛ اما در یوکاریوتها بسیار بیشتر دیده میشوند. تکرار آنکرین در بیشتر ویروسها، بهاستثنای پاکسویروسها، وجود ندارند. بیشتر پروتئینهای حاوی این موتیف، معمولاً دارای ۴ تا ۶ تکرار هستند. بیشترین تکرار آنکرین در نوعی پروتئین مترشحه از ژیاردیا لامبلیا یافت شدهاست که حاوی ۳۴ تکرار است.[2]
تکرارهای آنکرین معمولاً با یکدیگر چین میخورند تا یک ساختار سلنوئیدی خطی بسازند که بدان «دومینهای تکرار آنکرین» میگویند. این دومینها، یکی از فراوانترین پلتفرمهای تعامل پروتئین-پروتئین در طبیعت هستند.
تکرارهای آنکرین در انسان با بروی برخی از بیماریها مرتبط است که از آن میان میتوان به برخی سرطانها، کاداسیل[2] و رفتارهای عادتگونه یا اعتیادی همچون الکلیسم و وابستگی به نیکوتین و چاقی اشاره نمود.
منابع
- پیدیبی 1N11; Michaely P, Tomchick DR, Machius M, Anderson RG (December 2002). "Crystal structure of a 12 ANK repeat stack from human ANK1". EMBO J. 21 (23): 6387–96. doi:10.1093/emboj/cdf651. PMC 136955. PMID 12456646.
- Mosavi L, Cammett T, Desrosiers D, Peng Z (2004). "The ankyrin repeat as molecular architecture for protein recognition". Protein Sci. 13 (6): 1435–48. doi:10.1110/ps.03554604. PMC 2279977. PMID 15152081. Archived from the original on 2004-09-07.
- مشارکتکنندگان ویکیپدیا. «Ankyrin repeat». در دانشنامهٔ ویکیپدیای انگلیسی، بازبینیشده در ۲۰ ژانویه ۲۰۱۸.
پیوند به بیرون
- ردهٔ موتیفی LIG_TNKBM_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
- Ankyrin repeat در سرعنوانهای موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا
در ویکیانبار پروندههایی دربارهٔ تکرار آنکرین موجود است. |