پایگاه فراداده تنوع باکتریایی
پایگاه فراداده تنوع باکتریایی (به انگلیسی: the Bacterial Diversity Metadatabase، یا BacDive)، یک پایگاه فراداده است که اطلاعات مرتبط با خصوصیات تنوع زیستی باکتریها و باستانیان را تهیه میکند.
محتوا | |
---|---|
توضیح | اطلاعات مرتبط با خصوصیات تنوع زیستی باکتریها و باستانیان |
گونههای دادههای گرفتهشده | فراداده |
تماس | |
مرکز پژوهش | مجموعه میکروارگانیسمها و کشت سلولی آلمان(GmbH) |
استناد ابتدایی | ۲۶۴۲۴۸۵۲ |
تاریخ انتشار | ۲۰۱۲ |
دسترسی | |
وبگاه | http://bacdive.dsmz.de/ |
نشانی اینترنتی خدمات وب | http://bacdive.dsmz.de/api/ |
مقدمه
این پایگاه منبعی برای انواع مختلف فراداده مثل طبقهبندی، مرفولوژی، فیزیولوژی، محیط زیست و زیستشناسی مولکولی است.[1][2][3][4][5] اکثریت دادهها به صورت دستی حاشیهنویسی شده و سرپرستی میشوند. این پایگاه با انتشار در سپتامبر ۲۰۱۵ اطلاعاتی در مورد ۵۳٬۹۷۸ نژاد ارائه میدهد.[6] این پایگاه داده که بخشی از de.NBI شبکه آلمانی برای زیرساخت بیوانفورماتیک است توسط مجموعه میکروارگانیسمها و کشت سلولی آلمان(GmbH) میزبانی میشود.
منابع
- مشارکتکنندگان ویکیپدیا. «BacDive». در دانشنامهٔ ویکیپدیای انگلیسی، بازبینیشده در ۱۹ ژوئن ۲۰۱۷.
- Söhngen, C; Boyke, B; Podstawka, A; Gleim, D; Overmann, J (October 13, 2013). "BacDive - The Bacterial Diversity Metadatabase". Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D592–D599. doi:10.1093/nar/gkt1058.
- Fernández-Suárez, X. M.; Rigden, D. J.; Galperin, M. Y. (December 5, 2013). "The 2014 Nucleic Acids Research Database Issue and an updated NAR online Molecular Biology Database Collection". Nucleic Acids Research. 42: D1–D6. doi:10.1093/nar/gkt1282. PMC 3965027. PMID 24316579.
- Cohan lab (October 23, 2015). "DSMZ's BacDive Bacterial Diversity Database".
- Abu-Jamous, Basel; Fa, Rui; Nandi, Asoke K. (2015). Integrative Cluster Analysis in Bioinformatics. John Wiley & Sons. p. 448.
- Zhulin, I. B. (August 1, 2015). "Databases for Microbiologists". Journal of Bacteriology. 197 (15): 2458–2467. doi:10.1128/JB.00330-15.
- Söhngen, C; Podstawka, A; Boyke, B; Gleim, D; Vetcininova, A; Reimer, LC; Ebeling, C; Pendarovski, C; Overmann, J (September 30, 2015). "BacDive - The Bacterial Diversity Metadatabase in 2016". Nucleic Acids Research. 44 (Database issue): D581–D585. doi:10.1093/nar/gkv983. PMC 4702946. PMID 26424852.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.